Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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