Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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