Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd2V9GX34 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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