Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac6Q9Z2V5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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