Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Crlf3Q9Z2L7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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