Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Letm1Q9Z2I0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms