Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms