Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn1Q9Z0I7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn1Q9Z0I7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms