Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms