Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed2Q9R0Q3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms