Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Wdr54Q9R0D8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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