Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fhl3Q9R059 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms