Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc4Q9QZD4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ercc4Q9QZD4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc4Q9QZD4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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