Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnt3Q9QZ47 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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