Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Snai3Q9QY31 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms