Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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