Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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