Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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