Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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