Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms