Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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