Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms