Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms