Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmbr1Q9JIT0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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