Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ush1cQ9ES64 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ush1cQ9ES64 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ush1cQ9ES64 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ush1cQ9ES64 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ush1cQ9ES64 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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