Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Scn4aQ9ER60 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn4aQ9ER60 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms