Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms