Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hmg20aQ9DC33 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hmg20aQ9DC33 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms