Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms