Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms