Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms