Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc89Q9DA73 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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