Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SlirpQ9D8T7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms