Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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