Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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