Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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