Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Borcs8Q9D6Y4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms