Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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