Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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