Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms