Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms