Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2lQ9D478 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2lQ9D478 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2lQ9D478 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms