Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tspan11Q9D1D1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tspan11Q9D1D1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms