Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Susd3Q9D176 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms