Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc3Q9D114 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms