Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rfc5Q9D0F6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rfc5Q9D0F6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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