Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mms19Q9D071 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mms19Q9D071 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mms19Q9D071 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mms19Q9D071 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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