Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssbp3Q9D032 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ssbp3Q9D032 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ssbp3Q9D032 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp3Q9D032 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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