Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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