Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sugt1Q9CX34 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Sugt1Q9CX34 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sugt1Q9CX34 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sugt1Q9CX34 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sugt1Q9CX34 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sugt1Q9CX34 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sugt1Q9CX34 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms